鳜鱼喜欢瘦水的环境，水质不可偏酸以防止出现多种病害。养殖水体中要移植一些沉水植物，如轮叶黑藻等净化水质，有利于鳜鱼增加对疾病的抵抗力。
1、做好消毒工作
不管是苗种培育阶段，还是养殖成鱼阶段，对投喂的饵料鱼也必须加强检疫和药物消毒，投喂前的药浴消毒，现配现用消毒的药物常用8克/立方米的硫酸铜溶液浸泡20分钟，或用20克/立方米的高锰酸钾溶液浸泡20分钟。也可以对饵料鱼培育池全池泼洒药物消毒。
2、平时注意调水防病
在鳜鱼苗种培育期间，易患车轮虫等原生动物性疾病，可用含苦参碱成分的中草药进行预防。平时适宜用挂袋法预防疾病。常用的药物有漂白粉、硫酸铜和硫酸亚铁合剂（5:2）。一般把漂白粉装入竹制的挂篓内，每篓装漂白粉100克，每袋装硫酸铜100克和硫酸亚铁40克，每200平方米左右的水面设一处挂点即可，药物要求能达到5小时以上的溶解时间。
3、防病时用药注意事项
由于鳜鱼对有机磷杀虫剂、敌百虫非常敏感，故一般不使用敌百虫等药物，对硫酸铜、硫酸亚铁合剂也易产生明显的耐药性，故在预防鳜鱼疾病时尽量少使用这些药物。由于鳜鱼是底栖性鱼类，且有早晚捕食的习性。所以预防性用药时间一般要避开早晚，在中午前后用药，要做到泼洒均匀。鳜鱼在患有肠炎、烂鳃病和出血病时，需服用药饵，其投喂方式与其他水产品种不一样，由于鳜鱼是捕食活鱼的，药饵需先由饲料鱼吃进，再由鳜鱼捕食，用药量比较大。药饵投喂前，应在鳜鱼池中放入充足的饵料鱼，药饵投喂量为池中饵料鱼体重的5％～6％，保证药饵投喂量充足，鳜鱼捕食后药饵才能发挥作用。
鳜鱼养殖的过程当中，最容易出现的是寄生性的疾病以及病毒性烂鳃病等。应该注意监测水源，保持水质清洁，注意消毒和杀菌
可以对旧池池底进行清理，要检测水质，可以通过饵料来投喂病毒药。
注意亲鱼的强化培育，以提高鳜鱼卵的质量和抗病能力。产后亲鱼要及时护理，可涂抹孔雀石绿软膏，预防该病发生。卵产出后，立即用2毫克/升孔雀石绿溶液消毒。在鱼卵孵化过程中保持良好水质，已患病鱼卵按100毫克/升浓度泼洒孔雀石绿，停水5分钟后恢复流水，也可用0.2%食盐水和0.2%碳酸氢钠泼洒。