畸形蛋的发生大多数与母鸭的生殖器官患病有关，也与体内的物质代谢失常有关。常见的畸形蛋有双黄蛋、软壳蛋、薄壳蛋、无黄蛋、异物蛋、蛋中蛋等。(1) 双黄蛋正常蛋只有一个蛋黄，双黄蛋常较正常蛋大，破壳后有两个蛋黄，有时还可遇到三黄蛋，其成因与双黄蛋相同。
2个或2个以上的卵子同时成熟或成熟时间接近，排卵后相遇，被蛋白包围。这种现象在新母鸭中较常见，因为新母鸭生活力旺盛或者未完全达到性成熟。(2) 软壳蛋，薄壳蛋正常鸭蛋壳厚度一般不少于0。33毫米，厚度小于0。27毫米即为薄壳蛋，产生原因主要在于饲养管理不善。
蛋鸭长时间不断产蛋，所需钙质补充不足；环境温度过高，鸭的食欲减退，吃饲料相对少了，钙质供不应求；鸭舍拥挤，密度过大，引起应激，活动减少；疾病，患传染性支气管炎或鸭瘟时，吸收钙质功能降低，在疾病初期，不仅蛋壳变薄，而且蛋形不正常；注射疫苗后，也容易产生软壳蛋；饲料中钙、磷和维生素D不足，也易产生薄壳蛋，尤其是产蛋旺季；用药不当，一般使用药物的剂量应根据鸭的体重大小而定，用药过量时，也易产生薄壳蛋或软壳蛋；薄壳蛋如果占到1/3,可能是遗传性所致。
(3) 无黄蛋无黄蛋通常是小蛋，而小蛋不一定是无黄蛋。输卵管黏膜上皮脱落刺激输卵管分泌蛋白和蛋壳所致。如果经常产这种很小的异常蛋，可能是由于输卵管狭窄或阻塞的关系。有时发现小蛋内蛋白包着一部分蛋黄，是由于卵子碎块进人输卵管，刺激输卵管分泌蛋白，形成含有少量蛋黄的小蛋。
(4) 异物蛋鸭蛋正常打开后，有时可见系带附近或蛋白中有血块、血斑、肉斑、系膜、壳膜、凝固蛋白以及寄生虫等，这样的蛋都称为异物蛋。原因可能是因为卵巢出血；或者排卵时血管破裂，血流人蛋中；或者脱落卵泡膜随卵黄进入输卵管；或者输卵管内异常分泌的壳膜、凝固蛋白随蛋黄下行；或者肠道内寄生虫移行到泄殖腔，上爬进人输卵管又随卵黄下行，包入蛋白所致。
(5) 蛋中蛋有时可遇到特别大的蛋，破壳后里面还有一个正常的蛋，外包裹着蛋白、内外蛋壳膜和蛋壳，这叫蛋中蛋。这种蛋的形成，是因为蛋移行到子宫部形成蛋壳后，由于受惊或某些生理异常现象，输卵管发生逆蠕动，将形成的蛋推移到输卵管上部。恢复正常后，形成的蛋再向下移行，又包上蛋白、蛋壳膜和蛋壳，形成蛋中蛋。
