一、怎样才能办理合法养殖证书？
养殖证具体办理流程如下：
1、以企业法人身份登录企业所在地的区级政务服务网；
2、在部门导航栏内，选择该业务的受理部门“区市场监管局”；
3、在该部门受理列表中，找到“水域滩涂养殖证的审核”，点击“在线办理”；
4、确认审批条件、收取材料等信息，点击底部的“下一步”；
5、按系统引导提示要求，登记完善相关信息，并上传相应的申请材料，点击底部的“提交”，即可完成养殖证的申请。
养殖许可证的作用主要有：
1 、养殖证是养鱼生产者使用水域、滩涂从事养殖生产活动的合法权益，能够得到法律的保护，养殖证是合法的凭证；
2、养殖证是判断水域养殖使用功能的基础依据，当养殖水域因国家建设及其它项目征用或受到污染、爆破造成损失时，养殖者可凭养殖证申请补偿或进行索赔。渔业污染事故调查机构是以养殖证为受理案件的基础，养殖证登记内容是调查处理事故的重要依据；
3、水产养殖生产者要持养殖证才能够申请苗种生产审批、水生野生动物驯养繁殖证，水产品原产地证书，无公害农产品基地资格等，并享受国家税收等方面的优惠政策。
养殖许可证发证范围具体为：
1、利用全民所有的水域从事养鱼生产的国营渔场；
2、集体所有或者全民所有，由农业集体经营组织使用的水域从事渔业养殖生产的，通过合法手续取得水面承包经营权的单位及个人；
3、已领取土地承包权证书的农用土地改为养殖生产的，在不改变原土地的权属履行性质及土地基本用途的情况下发养殖证。
《中华人民共和国畜牧法》
第七条 国务院畜牧兽医行政主管部门负责全国畜牧业的监督管理工作。县级以上地方人民政府畜牧兽医行政主管部门负责本行政区域内的畜牧业监督管理工作。
县级以上人民政府有关主管部门在各自的职责范围内，负责有关促进畜牧业发展的工作。
二、畜牧养殖证怎么办理？
1,土地养殖设施用地证明(由当地县级以上政府审批发放)。
2，动检证(由当地县级以上畜牧局审核发放)，必须要具备几个基本条件，就是养殖场要有消毒通道，不管在大门处，还是进入生产区。还有就是养殖场里必须严格区分净道和污道的布局，不能交叉，这样算起来，养殖场生活区，料区，生产区必须要有3个大门。
3，接下来就可以到工商部门去核名了，不管养殖场还是公司，上面的两项和核名都是不可缺少的。
4，如果你申请公司的话，需要验资，有条件的话当然是越多越好，申请公司的话最好是找一个合伙人，名义上的不影响独立经营，这样今后的很多经营都方便，养殖场是不需要验资。
5，做合作社，现在国家正在大力提倡，养殖合作社是很有益的，不管是享受政策和日后经营，三人以上就可以申报但是必须其中两个是农业户口，当然找到的越多越好。养殖场加合作社或者公司加合作社都会得到政府的支持。现在国家鼓励企业加农户的合作模式。
三、养殖证如何办理？
一、《营业执照》
兴办小型养猪场，个人应向养殖用地所在村委会提出申请，并报备乡镇主管部门同意后，到当地工商局办理工商登记预核手续（场名预核），然后再进行办理企业或个体工商户《营业执照》，一般在农村兴办小型养猪场办理个体工商户《营业执照》即可。
二、项目备案手续
到当地畜牧部门办理养猪项目备案手续。
三、环评手续
委托有资质的环评公司编写环评报告，然后送环保局进行委托评审，最后评审通过拿到批文环评手续就算完成了。
四、《土地规划许可证》
养殖用地不可占用基本保护农田，远离居民区、学校、医院、科研单位、风景区、饮用水源地等区域，另外还需要位于当地划分的禁养区之外。可先撰写一份《养猪户可行性分析报告》，然后到当地国土资源部门办理养猪用地备案手续与《土地规划许可证》。
五、《动物检疫条件合格证》
持单位法人身份证及相关行业营业执照（复印件），到当地动物检疫检验局办理《动物检疫条件合格证》。
六、《税务登记证》
根据《农业部基本建设财务管理办法》、《农业基本建设管理办法》建立完善的财务制度，再持《营业执照》及《财务制度》到税务局办理《税务登记证》。
七、《建设施工许可证》
最后持《土地规划许可证》、《营业执照》、《动物防疫条件合格与环保证明》、《税务登记证》等，到建设局申请《建设施工许可证》。
